合同会社を設立した場合、個人事業主とは異なる税務手続きが求められます。法人税や住民税、事業税など、合同会社に課される税金の種類は多岐にわたり、それぞれ計算や申告の手続きが必要です。また、利益が出ていなくても申告義務があるため、法人運営においては確定申告の手続きを正確に行うことが求められます。本記事では、合同会社に必要な確定申告の基本知識から、税金の計算方法、決算の進め方、申告書類の準備方法までを詳しく解説します。
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【所属】
税理士法人Five Starパートナーズ 代表税理士
【経歴】
大阪府豊中市出身。関西学院大学経済学部卒業後、中原会計事務所に入所。2001年に税理士試験全科目合格。その後、新日本アーンスト・アンド・ヤング税理士法人で国際税務業務に従事。2005年にヒロ☆総合会計事務所を設立し、2022年に税理士法人Five Starパートナーズへ組織変更。また、YouTubeチャンネル「税理士YouTuberチャンネル!!」を運営し、税務や経営に関する情報を発信している。
保有資格: 税理士
※詳細やご自身の状況に応じた適切な対応については、税理士等の専門家にご相談ください。
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合同会社も確定申告が必要?
合同会社を設立すると、法人としての確定申告が必須となります。これは法人格を持つすべての企業に課される義務であり、たとえ利益が出ていない場合でも適用されます。赤字決算の場合でも、確定申告を行うことは将来の節税に役立つ場合があります。
確定申告を行うことで、赤字を翌年以降に繰り越して控除することが可能となります。これにより、将来利益が出た際の課税額を軽減できます。また、法人住民税に含まれる「均等割」の支払いが必要であるため、申告は避けて通れません。さらに、確定申告を適切に行うことは、税務調査のリスクを軽減し、法人運営の信頼性を向上させる重要なポイントでもあります。

合同会社にかかる税金とは
合同会社には、法人として以下の税金が課されます。それぞれの税金には異なる特性があり、計算や納付のタイミングも異なります。
法人税
法人税は、合同会社が得た利益(課税所得)に基づいて課される税金です。中小法人の場合、課税所得が800万円以下の部分には15%の軽減税率が適用され、800万円を超える部分には23.2%の税率が適用されます。たとえば、課税所得が1,000万円の場合、軽減税率適用分は800万円、超過分の200万円には通常税率が適用されます。このように分割して計算することで法人税額を求めます。

法人住民税
法人住民税は、地方自治体に納付する税金であり、均等割額と法人税割額から構成されます。均等割額は法人の規模や事業所の数に基づき、一定額が課されます。一方、法人税割額は法人税額に基づいて計算されるため、事業の利益状況に応じて変動します。
法人事業税
法人事業税は、事業を行う法人に課される税金で、所得金額に基づいて計算されます。税率は事業の種類や規模によって異なり、地方自治体ごとに設定されています。この税金は、会社の経営状況を反映したものであり、収益が多いほど高額になる傾向があります。
消費税
消費税は、年間の課税売上高が1,000万円を超える場合に課されます。事業開始から2年間は免税事業者として扱われることが多いですが、条件次第で課税事業者になることもあります。消費税の納付額は、課税売上高に基づく消費税額から、仕入れにかかる消費税額を差し引いて計算します。
税金それぞれの計算方法
合同会社に課される税金は、それぞれ計算方法が異なります。以下に主な計算方法を説明します。
法人税の計算
法人税額は、課税所得に税率を乗じて計算します。課税所得は、会社の収益から必要経費や損失を差し引いて求めます。軽減税率や特例の適用がある場合は、その内容を反映して計算します。
法人住民税の計算
法人住民税は、均等割額と法人税割額を合計して計算します。たとえば、均等割が7万円、法人税額に対する税率が10%の場合、法人税額が100万円であれば住民税は7万円+10万円=17万円となります。
法人事業税の計算
法人事業税は、課税所得に事業税率を乗じて計算します。たとえば、課税所得が1,000万円、事業税率が6%の場合、事業税額は60万円となります。
消費税の計算
消費税額は、売上高に税率(10%)を乗じた額から仕入れなどにかかる消費税額を差し引いて求めます。
合同会社の決算、確定申告の手順
合同会社の確定申告を行うには、事前に決算手続きを完了させる必要があります。以下は一般的な決算と確定申告の流れです。
帳簿書類の整理
まず、1年間の取引を記録した帳簿を整理します。収支の記録、領収書や請求書の確認を行い、正確なデータを整えます。これが決算の基礎となります。
決算整理仕訳をする
決算時には、収益や費用を整理し、必要な仕訳を行います。たとえば、減価償却費の計上や未払費用、未収収益の処理を行います。これにより、正確な損益状況を把握できます。
決算書の作成
決算書は、貸借対照表や損益計算書を含む重要な書類です。貸借対照表では会社の資産や負債の状況を明確にし、損益計算書では収益や費用、利益をまとめます。
計算書類の承認をする
合同会社では、社員総会で計算書類を承認する必要があります。このプロセスを経て初めて確定申告に進むことができます。
確定申告と納税を行う
確定申告書を作成し、税務署や地方自治体に提出します。法人税や住民税、事業税を納付し、これで申告手続きが完了します。
合同会社のための確定申告に必要な書類
合同会社の確定申告を進める上で、必要な書類を正確に揃えることが重要です。これらの書類は税務署に提出するだけでなく、会社の財務状況を正確に把握するためにも役立ちます。以下に主要な書類を詳しく説明します。
法人税申告書
法人税申告書は、会社の利益に基づく法人税額を申告するための基本書類です。この申告書には課税所得、控除額、納付すべき税額などが記載されます。申告書を正確に作成することで、過不足なく納税が行えます。
適用額明細書
適用額明細書は、法人税や控除の適用状況を明確にするための書類です。例えば、軽減税率や特別控除の適用を受ける場合、この書類に詳細を記載します。この明細書がないと、税務署が控除の適用を認めない可能性があります。
貸借対照表
貸借対照表は、会社の資産、負債、純資産の状況を表す書類です。この書類を作成することで、会社がどのように資金を運用しているのか、また負債の状況はどうなっているのかが一目でわかります。税務申告においては必須の書類です。
損益計算書
損益計算書は、会社の収益や費用を記載し、一定期間の利益や損失を明らかにする書類です。この書類を基に法人税の計算が行われるため、正確な記録が必要です。
社員資本等変動計算書
社員資本等変動計算書は、資本金や純資産の増減を記録した書類です。この書類は、社員の出資状況や資本の変化を明確にするために使用されます。特に合同会社では、社員の出資割合が財務状況に直接関わるため、この書類が重要です。
勘定科目内訳明細書
勘定科目内訳明細書は、損益計算書や貸借対照表に記載された各勘定科目の詳細を説明するための書類です。例えば、売上高の内訳や借入金の内容を記載します。この書類により、税務署が会社の財務内容をより詳しく把握できます。
法人事業概況説明書
法人事業概況説明書は、会社の事業内容や運営状況を説明するための書類です。具体的には、従業員数、主要な事業活動、売上構成などを記載します。この書類は、会社の規模や事業活動を税務署に理解してもらうために役立ちます。

よくある間違いと注意点
合同会社の確定申告では、以下のようなミスがよく見られます。これらを回避するために、事前に準備を整え、十分な確認を行いましょう。
帳簿記録の不備
経費や収益の記録が不十分だと、正確な申告ができません。領収書や請求書を紛失しないよう、整理整頓を徹底しましょう。
申告書の記入ミス
数字の入力間違いや未記入の箇所があると、税務署から修正を求められる可能性があります。申告書作成後は、必ず内容を再確認してください。
控除の適用漏れ
使える控除を適用し忘れると、余分な税金を支払うことになりかねません。特に法人税の特例や軽減措置を確認しましょう。
期限の遅れ
申告期限を過ぎると、延滞税や無申告加算税が発生します。期限内に必ず申告を行いましょう。
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まとめ
合同会社の確定申告は、法人税や事業税、住民税、消費税など、個人事業主よりも多岐にわたる税務対応が求められます。適切な帳簿整理や正確な書類作成を行うことで、申告業務をスムーズに進めることができます。また、税理士や最新の会計ソフトを活用することで、ミスを防ぎ、効率的に業務を進めることが可能です。初めての確定申告でも、この記事を参考に準備を進めれば安心して取り組めるでしょう。
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よくある質問
確定申告をしなかったらどうなるの?
申告を怠ると、無申告加算税や延滞税が課され、場合によっては税務調査の対象になる可能性があります。
確定申告の内容を間違えてしまった場合は?
修正申告を行うことで、間違いを訂正することが可能です。ミスに気付いたら早めに税務署に相談してください。
確定申告の時期はいつ?
合同会社の確定申告は、決算日から2か月以内に行う必要があります。たとえば、3月末が決算日の場合、申告期限は5月末となります。
決算はいつ?
決算日は会社設立時に決めた事業年度末に行います。事業年度は12か月以内で自由に設定できますが、期末が決まったら毎年同じ時期に決算と申告を行う必要があります。
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