「いきなり税務署から連絡が来たらどうしよう」個人事業主であっても、税務調査の対象となる可能性はゼロではありません。むしろ小規模事業者だからこそ、帳簿や領収書の管理が“自己流”になりやすく、調査の指摘を受けやすい傾向があります。この記事ではまず税務調査の全体像を整理し、どんな事業者が狙われやすいのかを具体的に示したうえで、日頃から実践できる対策と実際に調査が入ったときの対応をわかりやすく解説します。
タックスナップは、フリーランスや個人事業主に特化したクラウド型会計ソフトで、”カンタン”・”安心”に特化したスマホだけで経理から確定申告まで完結できるアプリです。特徴的なスワイプ仕分けは、従来と比較し手間を1/10以下に削減することができ、丸投げ仕分けは1,000件を10秒程度で仕分けする画期的な機能です。また安心を担保するために、税理士監修の税務調査リスクチェック機能も搭載。さらに、他の会計ソフトからのデータ移行もスムーズに行え、経理業務を効率的にサポートします。
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【所属】
税理士法人Five Starパートナーズ 代表税理士
【経歴】
大阪府豊中市出身。関西学院大学経済学部卒業後、中原会計事務所に入所。2001年に税理士試験全科目合格。その後、新日本アーンスト・アンド・ヤング税理士法人で国際税務業務に従事。2005年にヒロ☆総合会計事務所を設立し、2022年に税理士法人Five Starパートナーズへ組織変更。また、YouTubeチャンネル「税理士YouTuberチャンネル!!」を運営し、税務や経営に関する情報を発信している。
保有資格: 税理士
※詳細やご自身の状況に応じた適切な対応については、税理士等の専門家にご相談ください。
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個人事業主にも税務調査はくる
税務調査の流れとは
- 事前通知(原則)
多くの場合、調査の1〜2週間前に税務署から「調査のお知らせ」が電話または書面で届きます(無予告の現況調査もあり)。 - 帳簿・書類の準備
調査日時までに仕訳帳・総勘定元帳・請求書・領収書などを揃えます。 - 実地調査(1〜2日が一般的)
調査官が事務所や自宅を訪れ、帳簿の突合やヒアリングを実施。 - 指摘事項の説明と修正申告
誤りが見つかった場合はその場で説明を受け、後日修正申告・追徴納税が必要になります。
税務調査に入られやすい個人事業主の特徴とは?
確定申告をしていない
そもそも申告義務を果たしていないと、預金口座情報や取引先からの情報提供で発覚しやすく、優先的に調査対象になります。
売上が少し1000万円を下回る
消費税課税事業者のライン(2年前売上1,000万円)を意識して「わざと」少し下回る売上を申告していると疑われるケースがあります。
売上が急増している
前年対比で売上が急激に伸びている場合は、経理体制が追いつかず誤計上が多いとの理由で調査頻度が高まります。
経費計上の費用が多額
売上に比べ経費比率が極端に高いと、「家事関連費の混入」や「架空経費」の可能性を疑われやすくなります。
利益が少額
長年赤字や利益が極端に少ない場合、事業継続性や生活費との辻褄が合わないとして調査対象になることがあります。
その他
- 現金商売が多い:飲食・小売・理美容など現金取引中心の業種は売上除外リスクが高い。
- 海外取引や暗号資産の取引がある:情報連携が進み、申告漏れとして重点調査。
- 匿名 tip-offs(タレコミ):元従業員・取引先からの情報提供によって調査が入る例も。
税務調査が入られた場合の対策と対応
正確な帳簿管理を徹底する
日々の売上・経費をリアルタイムに入力し、領収書や請求書はスキャン保存。電子帳簿保存法に準拠しておくと調査官の信頼度が上がります。
適切な経費計上を行う
家事按分(自宅家賃・光熱費など)は合理的な按分比率を根拠資料付きで提示できるようにし、領収書の裏に用途メモを書いておくと説明がスムーズです。
その他
- 現金実査の準備:調査当日の現金残高をメモし、帳簿残高と一致させておく。
- 回答は事実ベースで簡潔に:推測や憶測で答えず、分からない場合は後日資料提出で対応。
- 税理士同席の検討:専門家が同席することで質問が整理され、不必要な延長を防げます。

よくある間違いと注意点
税務調査は「悪質な脱税をしている事業者だけが対象」と誤解し、帳簿管理を後回しにする人が少なくありません。実際には、申告漏れや経費按分のミスといったケアレスミスでも追徴課税の対象になります。また、調査官に対して感情的に反論すると、かえって調査が長期化する恐れがあるので注意が必要です。調査通知を受け取ったら冷静に帳簿・証憑を整理し、説明資料を用意したうえで、必要に応じて税理士に相談しましょう。
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タックスナップは、フリーランスや個人事業主のために開発された画期的なクラウド型会計ソフトです。スマートフォンだけで経理や確定申告をスムーズに完結させることができ、ユーザーの利便性と安心を両立した設計が特長です。
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丸投げ仕分け & スワイプ機能
タックスナップの「スワイプ仕分け」機能は、金融機関と連携していれば、スマホで経費や売上を右、プライベートを左にスワイプするだけで、手間なく直感的に仕分けが完了します。また、「丸投げ仕分け」機能は、スワイプ操作すら省略したい方に最適で、すべての仕分けをタックスナップ側が自動で処理。1,000件の仕分けも約10秒で完了するため、驚くほど効率的に仕分けが行えます。
税理士監修の税務調査リスクチェック
確定申告の際に多くの方が不安を感じるのが税務調査ですが、タックスナップでは税理士監修の「税務調査リスクチェック」機能を搭載。申告内容をシステムがチェックし、リスクのある項目をユーザーに知らせてくれるため、税務調査への対策がしやすくなり、安心して確定申告を完了できます。
他会計ソフトからのスムーズな乗り換え
既に他の会計ソフトを利用している場合も、タックスナップへの移行は非常に簡単です。データのインポート機能が備わっており、過去のデータもシームレスに引き継げるので、乗り換えの手間をかけずにスムーズに使用を開始できます。
スマホで提出まで完結
経理業務の全てがスマホで完結します。確定申告の書類作成から提出まで、スマホでの操作で簡単に進められ、時間と手間を大幅に削減します。
レシート読み取り機能で経費管理が簡単
レシートを手作業で入力する手間を省くため、タックスナップは高精度の「レシート読み取り」機能を搭載。スマホのカメラでレシートを撮影するだけで、瞬時に必要な情報を読み取り、データを自動で整理して仕訳に反映させます。これにより、経費入力のミスを減らし、時間を節約できます。
タックスナップは、シンプルで使いやすく豊富な機能で、フリーランスや個人事業主の経理の手間を劇的に軽減します。今すぐタックスナップを使い始めて、経理業務をもっとスマートにしましょう。
まとめ
個人事業主でも税務調査は日常的に行われており、無申告・極端な経費比率・売上急増といった特徴があると優先的に対象になりやすいのが実情です。日頃から正確な帳簿管理と根拠資料の保存を徹底し、調査通知が来ても慌てず対応できる体制を整えておきましょう。タックスナップを活用すれば仕訳ミスや証憑不足を自動でチェックでき、税務調査時の不安を大幅に軽減できます。
タックスナップは、簡単さと安心感を兼ね備え、フリーランスや個人事業主の経理・確定申告をサポートする強力な会計ツールです。スワイプで手軽に取引を仕分けし、自動仕分けで更に効率を追求。税務調査リスクチェックで安心感を高め、スマホ一台で提出まで完結できる便利さで、経理のストレスを大幅に軽減します。他会計ソフトからの乗り換えも簡単なので、今すぐ試してみる価値があります。
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よくある質問
個人事業主に税務調査が入る確率はどのくらい?
国税庁統計では個人事業主全体の調査率はおおむね2〜3%程度ですが、高リスク業種や売上規模によって変動します。
追徴課税の額の平均は?
最新統計(令和5事務年度)では、所得税の1件あたり追徴税額は約120万円。ただし申告漏れ割合が大きいと数百万円規模になることも。

税務調査の連絡は事前にありますか?
原則として電話または書面で事前通知がありますが、無予告で現況確認が行われるケースも稀にあります。
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