【2026年最新版】医療費控除はスマホでできる？入口の選び方とマイナポータル連携で自動集計するやり方を解説

2026年7月6日

この記事のポイント

医療費控除の申告はスマホひとつで完結でき、PCは不要

申告の入口は「確定申告書等作成コーナー」か「確定申告アプリ」の2択

マイナポータル連携で医療費通知情報を自動取得でき、領収書の集計を省ける

連携で取れない分は医療費控除の明細書か医療費集計フォームに手入力

対象は年間医療費10万円超（総所得等200万円未満は5%超）で控除上限は200万円

医療費控除はスマホでできる？やり方の全体像と入口の選び方

医療費控除はスマホだけで完結でき、PCは必要ありません。作業は「①入口を選ぶ→②医療費を集計→③e-Taxで送信」の3ステップで、最初に入口を決めるのが最短ルートです。

スマホでの申告の入口は2つ

入口は、国税庁の「確定申告書等作成コーナー」か、民間の「確定申告アプリ」の大きく2つです。料金や案内の手厚さが違うので、目的で選ぶと迷いません。

入口	料金	記帳の要否	案内の手厚さ	向いている人
確定申告書等作成コーナー（国税庁）	無料	不要（その年の医療費を入力）	画面案内はあるが項目は多め	医療費控除だけを年1回申告する人
確定申告アプリ（例：タックスナップ）	無料〜	アプリにより異なる	質問に答える形で手厚い	迷わずスマホで終えたい人・事業所得もある人

マイナポータルアプリからも入れる

入口はマイナポータルアプリからもたどれます。マイナポータルの「確定申告の事前準備」からe-Tax・作成コーナーへ進む導線があり、そのままマイナポータル連携の設定にも入れます。どの入口でも、最後はe-Taxで送信する点は共通です。

スマホで医療費控除を申告する前に用意するもの

必要なのは、マイナンバーカードと読み取れるスマホ、マイナポータルアプリ、そして医療費や収入の情報です。先にそろえておくと、途中で止まりません。

マイナンバーカードと対応スマホ・マイナポータルアプリ

マイナンバーカードと、それを読み取れる対応スマホを用意し、マイナポータルアプリをインストールします。ログインでは、券面事項入力補助用の4桁の暗証番号と、署名用電子証明書のパスワード（英数字6〜16桁）を使う場面があるので、事前に確認しておきましょう。

マイナンバーカードがない場合

マイナンバーカードがない場合は、税務署で事前に発行するID・パスワード方式で申告できることがあります。ただしID・パスワードの新規発行は令和7年（2025年）10月1日から停止されているため、これから始めるならカードを用意するのが確実です。

そのほか用意するもの

医療費控除に必要な情報として、給与所得者は源泉徴収票の内容、そして1年分の医療費の領収書または医療費通知を準備します。還付金を受け取る本人名義の口座番号も控えておくと、入力がスムーズです。

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マイナポータル連携で医療費を自動集計する手順

マイナポータル連携を使うと、医療費通知情報を自動で取得して申告書に反映でき、領収書を1枚ずつ集計する手間を省けます。スマホでの医療費控除がぐっとラクになる中心の機能です。

医療費通知情報を自動取得する流れ

マイナポータルとe-Taxを連携し、取得する情報で「医療費通知情報」にチェックを入れると、申告書の医療費控除欄に金額が自動で反映されます。生計を一にする家族分も、事前に代理人設定をしておけばまとめて取得できます。

1年分がそろう時期

医療費通知情報は毎月11日に前々月の診療分が更新され、確定申告用の1年分は原則2月9日に一括で取得できます（デジタル庁）。2月上旬までは前年12月分などが反映されないことがあるため、早く申告したいときは時期に注意しましょう。

連携で取れない医療費の集計方法

マイナポータル連携で取得できない医療費は、医療費控除の明細書に手入力します。領収書が多いときは、国税庁の「医療費集計フォーム」（Excel）に入力して作成コーナーに読み込ませると便利です。連携分は自動、それ以外は手入力、と役割を分けて考えると整理できます。

スマホで医療費控除を申告して送信するまで

医療費を集計したら、収入や控除を入力し、還付額を確認して送信します。作成コーナーもアプリも、画面の案内に沿って進めば完了します。

収入・控除を入力して送信する

源泉徴収票の内容や医療費控除額を入力すると、還付される見込み額が画面に表示されます。内容を確認したうえで、マイナンバーカードで電子署名して送信すれば申告は完了です。送信後は受信通知を保存しておくと、提出の記録になります。

領収書は提出不要・5年保管／アプリなら案内に沿うだけ

医療費の領収書は提出不要ですが、自宅で5年間保管する必要があります。e-Taxでの送信の細かい手順は、医療費控除をe-Taxで申告する方法を解説した記事で詳しく確認できます。確定申告アプリなら、質問に答える形で入力から送信まで案内されるため、初めてでも迷いにくいのが利点です。

まとめ

医療費控除はスマホだけで申告でき、入口は「確定申告書等作成コーナー」か「確定申告アプリ」の2択です。マイナポータル連携で医療費通知情報を自動取得すれば、領収書の集計を大きく省けます。連携で取れない分は明細書や医療費集計フォームに手入力し、対象は年間医療費10万円超・控除上限200万円と押さえておけば、スマホで迷わず進められます。